Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR1P36897 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR1P36897 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms