Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT20P35900 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT20P35900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT20P35900 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT20P35900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT20P35900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT20P35900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT20P35900 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT20P35900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT20P35900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT20P35900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT20P35900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT20P35900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT20P35900 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms