Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COPB2P35606 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPB2P35606 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPB2P35606 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPB2P35606 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPB2P35606 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPB2P35606 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COPB2P35606 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COPB2P35606 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPB2P35606 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPB2P35606 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPB2P35606 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPB2P35606 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPB2P35606 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB2P35606 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB2P35606 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB2P35606 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB2P35606 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPB2P35606 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPB2P35606 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPB2P35606 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPB2P35606 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB2P35606 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB2P35606 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB2P35606 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPB2P35606 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COPB2P35606 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPB2P35606 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPB2P35606 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB2P35606 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB2P35606 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB2P35606 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB2P35606 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPB2P35606 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPB2P35606 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB2P35606 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB2P35606 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB2P35606 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPB2P35606 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB2P35606 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB2P35606 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB2P35606 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPB2P35606 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COPB2P35606 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPB2P35606 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPB2P35606 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPB2P35606 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPB2P35606 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB2P35606 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB2P35606 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB2P35606 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPB2P35606 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB2P35606 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB2P35606 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPB2P35606 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPB2P35606 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB2P35606 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB2P35606 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPB2P35606 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB2P35606 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB2P35606 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPB2P35606 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms