Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT9P35527 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT9P35527 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT9P35527 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT9P35527 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT9P35527 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT9P35527 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT9P35527 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT9P35527 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT9P35527 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT9P35527 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT9P35527 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT9P35527 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT9P35527 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT9P35527 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT9P35527 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT9P35527 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT9P35527 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT9P35527 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT9P35527 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT9P35527 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT9P35527 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT9P35527 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT9P35527 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT9P35527 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT9P35527 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT9P35527 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT9P35527 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT9P35527 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT9P35527 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT9P35527 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT9P35527 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT9P35527 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT9P35527 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT9P35527 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT9P35527 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms