Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
THBS4P35443 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
THBS4P35443 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
THBS4P35443 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
THBS4P35443 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
THBS4P35443 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
THBS4P35443 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
THBS4P35443 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
THBS4P35443 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
THBS4P35443 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
THBS4P35443 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
THBS4P35443 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
THBS4P35443 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
THBS4P35443 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
THBS4P35443 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
THBS4P35443 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
THBS4P35443 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
THBS4P35443 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
THBS4P35443 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms