Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM5P33992 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM5P33992 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM5P33992 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM5P33992 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM5P33992 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM5P33992 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM5P33992 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM5P33992 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM5P33992 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM5P33992 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM5P33992 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM5P33992 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM5P33992 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM5P33992 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM5P33992 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCM5P33992 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM5P33992 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM5P33992 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM5P33992 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM5P33992 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM5P33992 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM5P33992 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM5P33992 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM5P33992 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM5P33992 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM5P33992 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM5P33992 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM5P33992 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM5P33992 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM5P33992 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM5P33992 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM5P33992 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM5P33992 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM5P33992 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MCM5P33992 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MCM5P33992 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM5P33992 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM5P33992 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM5P33992 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM5P33992 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM5P33992 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM5P33992 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM5P33992 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM5P33992 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM5P33992 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM5P33992 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM5P33992 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms