Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-FP30511 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HLA-FP30511 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-FP30511 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms