Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TM4SF1P30408 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TM4SF1P30408 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF1P30408 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TM4SF1P30408 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TM4SF1P30408 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms