Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND2P30279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND2P30279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND2P30279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND2P30279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND2P30279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCND2P30279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCND2P30279 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCND2P30279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND2P30279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND2P30279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCND2P30279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND2P30279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCND2P30279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND2P30279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND2P30279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCND2P30279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND2P30279 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND2P30279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND2P30279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND2P30279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND2P30279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND2P30279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND2P30279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND2P30279 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND2P30279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND2P30279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND2P30279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND2P30279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND2P30279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND2P30279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND2P30279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND2P30279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND2P30279 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND2P30279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND2P30279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND2P30279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND2P30279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCND2P30279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND2P30279 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCND2P30279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms