Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHC1P29353 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHC1P29353 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHC1P29353 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHC1P29353 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHC1P29353 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHC1P29353 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHC1P29353 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHC1P29353 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHC1P29353 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHC1P29353 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHC1P29353 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHC1P29353 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHC1P29353 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHC1P29353 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHC1P29353 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHC1P29353 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHC1P29353 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHC1P29353 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHC1P29353 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHC1P29353 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHC1P29353 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHC1P29353 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHC1P29353 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHC1P29353 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHC1P29353 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHC1P29353 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHC1P29353 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms