Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX2P28328 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX2P28328 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX2P28328 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX2P28328 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX2P28328 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX2P28328 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX2P28328 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX2P28328 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX2P28328 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX2P28328 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX2P28328 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX2P28328 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX2P28328 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX2P28328 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX2P28328 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX2P28328 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX2P28328 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX2P28328 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX2P28328 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX2P28328 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX2P28328 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX2P28328 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX2P28328 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX2P28328 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX2P28328 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX2P28328 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms