Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXP28300 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXP28300 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXP28300 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXP28300 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXP28300 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXP28300 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXP28300 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXP28300 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LOXP28300 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LOXP28300 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXP28300 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXP28300 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXP28300 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXP28300 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LOXP28300 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXP28300 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXP28300 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXP28300 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LOXP28300 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LOXP28300 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXP28300 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXP28300 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXP28300 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LOXP28300 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LOXP28300 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXP28300 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXP28300 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXP28300 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LOXP28300 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LOXP28300 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LOXP28300 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXP28300 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXP28300 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXP28300 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LOXP28300 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LOXP28300 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LOXP28300 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LOXP28300 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms