Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD1P28289 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD1P28289 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD1P28289 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMOD1P28289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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