Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1BP28222 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1BP28222 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms