Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POU1F1P28069 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POU1F1P28069 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms