Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLNP26678 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLNP26678 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLNP26678 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLNP26678 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PLNP26678 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLNP26678 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLNP26678 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLNP26678 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLNP26678 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms