Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA3P26006 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms