Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX3P23760 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAX3P23760 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX3P23760 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAX3P23760 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAX3P23760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX3P23760 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX3P23760 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX3P23760 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAX3P23760 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAX3P23760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX3P23760 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAX3P23760 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX3P23760 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAX3P23760 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAX3P23760 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAX3P23760 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAX3P23760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms