Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX7P23759 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX7P23759 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX7P23759 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX7P23759 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAX7P23759 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PAX7P23759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAX7P23759 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX7P23759 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX7P23759 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX7P23759 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX7P23759 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX7P23759 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX7P23759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX7P23759 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX7P23759 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX7P23759 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX7P23759 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX7P23759 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAX7P23759 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAX7P23759 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX7P23759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX7P23759 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.9 ms