Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN1P21941 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN1P21941 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN1P21941 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN1P21941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN1P21941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN1P21941 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN1P21941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN1P21941 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN1P21941 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN1P21941 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN1P21941 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN1P21941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN1P21941 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN1P21941 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN1P21941 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN1P21941 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN1P21941 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN1P21941 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN1P21941 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN1P21941 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN1P21941 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN1P21941 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN1P21941 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN1P21941 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN1P21941 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN1P21941 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN1P21941 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN1P21941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN1P21941 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN1P21941 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN1P21941 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN1P21941 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms