Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BPBP20851 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4BPBP20851 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms