Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC1P18887 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC1P18887 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XRCC1P18887 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRCC1P18887 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms