Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6GP18545 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6GP18545 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6GP18545 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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