Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCLP18206 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VCLP18206 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCLP18206 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCLP18206 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCLP18206 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCLP18206 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCLP18206 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCLP18206 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCLP18206 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCLP18206 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCLP18206 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCLP18206 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCLP18206 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCLP18206 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCLP18206 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCLP18206 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCLP18206 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCLP18206 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCLP18206 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCLP18206 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCLP18206 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCLP18206 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCLP18206 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCLP18206 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCLP18206 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCLP18206 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCLP18206 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCLP18206 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCLP18206 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCLP18206 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCLP18206 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCLP18206 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCLP18206 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCLP18206 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms