Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB5P18084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB5P18084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms