Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AMD1P17707 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AMD1P17707 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMD1P17707 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMD1P17707 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMD1P17707 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMD1P17707 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMD1P17707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMD1P17707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMD1P17707 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMD1P17707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMD1P17707 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMD1P17707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMD1P17707 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMD1P17707 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMD1P17707 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms