Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA2P17301 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA2P17301 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA2P17301 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms