Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF3P15923 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF3P15923 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF3P15923 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF3P15923 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF3P15923 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF3P15923 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF3P15923 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF3P15923 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF3P15923 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF3P15923 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF3P15923 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF3P15923 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF3P15923 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF3P15923 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF3P15923 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCF3P15923 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF3P15923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF3P15923 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF3P15923 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF3P15923 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF3P15923 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF3P15923 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF3P15923 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF3P15923 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF3P15923 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF3P15923 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF3P15923 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF3P15923 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms