Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAG1P15918 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAG1P15918 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAG1P15918 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAG1P15918 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAG1P15918 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAG1P15918 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAG1P15918 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAG1P15918 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAG1P15918 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAG1P15918 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG1P15918 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAG1P15918 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAG1P15918 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAG1P15918 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAG1P15918 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAG1P15918 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAG1P15918 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAG1P15918 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG1P15918 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAG1P15918 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAG1P15918 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAG1P15918 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAG1P15918 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAG1P15918 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAG1P15918 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAG1P15918 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAG1P15918 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAG1P15918 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAG1P15918 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAG1P15918 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAG1P15918 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAG1P15918 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAG1P15918 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAG1P15918 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAG1P15918 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAG1P15918 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms