Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRF1P14222 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRF1P14222 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRF1P14222 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRF1P14222 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRF1P14222 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRF1P14222 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRF1P14222 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRF1P14222 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRF1P14222 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRF1P14222 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRF1P14222 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRF1P14222 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRF1P14222 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRF1P14222 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRF1P14222 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRF1P14222 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRF1P14222 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRF1P14222 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRF1P14222 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRF1P14222 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRF1P14222 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRF1P14222 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRF1P14222 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRF1P14222 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRF1P14222 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRF1P14222 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms