Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEACAM1P13688 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEACAM1P13688 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms