Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFP11831 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFP11831 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFP11831 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFP11831 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRFP11831 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFP11831 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFP11831 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRFP11831 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRFP11831 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRFP11831 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRFP11831 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRFP11831 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRFP11831 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRFP11831 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRFP11831 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRFP11831 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRFP11831 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRFP11831 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRFP11831 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRFP11831 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRFP11831 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRFP11831 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRFP11831 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRFP11831 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SRFP11831 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRFP11831 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRFP11831 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRFP11831 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRFP11831 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRFP11831 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRFP11831 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRFP11831 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRFP11831 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRFP11831 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRFP11831 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRFP11831 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRFP11831 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRFP11831 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRFP11831 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRFP11831 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRFP11831 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms