Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESRRAP11474 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESRRAP11474 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms