Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PYGBP11216 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PYGBP11216 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYGBP11216 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYGBP11216 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYGBP11216 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYGBP11216 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PYGBP11216 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PYGBP11216 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PYGBP11216 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PYGBP11216 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PYGBP11216 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGBP11216 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGBP11216 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PYGBP11216 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PYGBP11216 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGBP11216 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGBP11216 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGBP11216 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGBP11216 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYGBP11216 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGBP11216 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYGBP11216 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGBP11216 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGBP11216 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGBP11216 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms