Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2P10911 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCF2P10911 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MCF2P10911 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2P10911 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2P10911 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2P10911 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2P10911 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2P10911 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2P10911 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2P10911 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2P10911 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2P10911 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCF2P10911 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCF2P10911 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2P10911 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2P10911 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2P10911 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2P10911 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCF2P10911 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCF2P10911 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2P10911 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2P10911 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2P10911 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2P10911 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCF2P10911 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2P10911 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2P10911 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2P10911 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2P10911 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2P10911 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2P10911 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms