Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARAP10276 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARAP10276 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARAP10276 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARAP10276 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARAP10276 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARAP10276 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARAP10276 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARAP10276 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARAP10276 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARAP10276 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARAP10276 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARAP10276 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARAP10276 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RARAP10276 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARAP10276 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARAP10276 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARAP10276 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARAP10276 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RARAP10276 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARAP10276 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARAP10276 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARAP10276 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARAP10276 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARAP10276 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARAP10276 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARAP10276 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARAP10276 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RARAP10276 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms