Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBBP0CG47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBBP0CG47 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms