Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM253P0C7T8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM253P0C7T8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM253P0C7T8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms