Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYNP07948 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYNP07948 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYNP07948 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYNP07948 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LYNP07948 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYNP07948 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYNP07948 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYNP07948 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYNP07948 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYNP07948 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYNP07948 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYNP07948 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNP07948 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNP07948 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNP07948 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYNP07948 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYNP07948 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYNP07948 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYNP07948 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYNP07948 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNP07948 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYNP07948 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms