Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMP06732 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMP06732 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMP06732 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMP06732 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMP06732 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMP06732 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMP06732 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMP06732 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMP06732 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMP06732 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMP06732 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMP06732 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMP06732 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKMP06732 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKMP06732 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMP06732 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMP06732 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMP06732 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMP06732 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMP06732 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMP06732 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMP06732 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMP06732 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMP06732 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMP06732 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMP06732 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMP06732 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKMP06732 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKMP06732 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKMP06732 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMP06732 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms