Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TYMSP04818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TYMSP04818 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TYMSP04818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TYMSP04818 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TYMSP04818 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TYMSP04818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TYMSP04818 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TYMSP04818 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TYMSP04818 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TYMSP04818 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYMSP04818 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYMSP04818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYMSP04818 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYMSP04818 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYMSP04818 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYMSP04818 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.9 ms