Protein–RNA interactions for Protein: P03928

MT-ATP8, ATP synthase protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP8P03928 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MT-ATP8P03928 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MT-ATP8P03928 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MT-ATP8P03928 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms