Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL2A1P02458 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL2A1P02458 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL2A1P02458 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL2A1P02458 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms