Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGKV1-17P01599 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-17P01599 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-17P01599 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms