Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NSD2O96028 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD2O96028 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD2O96028 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD2O96028 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NSD2O96028 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD2O96028 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD2O96028 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD2O96028 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NSD2O96028 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NSD2O96028 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSD2O96028 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NSD2O96028 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSD2O96028 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD2O96028 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NSD2O96028 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NSD2O96028 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NSD2O96028 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NSD2O96028 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NSD2O96028 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD2O96028 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD2O96028 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD2O96028 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD2O96028 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NSD2O96028 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD2O96028 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD2O96028 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD2O96028 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD2O96028 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NSD2O96028 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD2O96028 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NSD2O96028 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NSD2O96028 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NSD2O96028 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD2O96028 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NSD2O96028 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NSD2O96028 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD2O96028 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD2O96028 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD2O96028 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NSD2O96028 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD2O96028 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD2O96028 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD2O96028 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NSD2O96028 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NSD2O96028 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD2O96028 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD2O96028 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD2O96028 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NSD2O96028 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD2O96028 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD2O96028 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD2O96028 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD2O96028 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NSD2O96028 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NSD2O96028 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSD2O96028 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms