Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX11BO96011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX11BO96011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms