Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD3O95983 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD3O95983 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD3O95983 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD3O95983 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD3O95983 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD3O95983 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD3O95983 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD3O95983 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD3O95983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD3O95983 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD3O95983 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MBD3O95983 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD3O95983 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD3O95983 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD3O95983 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD3O95983 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD3O95983 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD3O95983 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD3O95983 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD3O95983 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD3O95983 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD3O95983 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD3O95983 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD3O95983 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD3O95983 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD3O95983 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD3O95983 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD3O95983 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD3O95983 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD3O95983 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD3O95983 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MBD3O95983 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MBD3O95983 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD3O95983 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD3O95983 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD3O95983 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD3O95983 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD3O95983 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms