Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR1AO95602 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR1AO95602 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR1AO95602 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR1AO95602 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR1AO95602 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms