Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNUPNO95149 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNUPNO95149 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms