Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRPM2O94759 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRPM2O94759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRPM2O94759 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRPM2O94759 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRPM2O94759 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms